Durante la Tercera Gran Guerra Mundial Shinobi, se les asignó una misión en la cual deberían destruír el puente enemigo ( Puente Kannabi ), en dicha misión Rin, compañera de Obito y Kakashi, fue secuestrada y Obito sin dudarlo fue a su rescate, no sin antes discutir con Kakashi sobre rescatarla o seguir con la misión y lo deja impactado diciendo "El Colmillo Blanco de Konoha fue un verdadero héroe" y," en el mundo ninja aquellos que rompen las reglas son escoria, pero aquellos que abandonan a un amigo son peor que escoria". Después de esta discusión, que dejó a Kakashi impactado, fue al rescate de Rin apoyado por Kakashi, enfrentándose a un primer enemigo, Taiseki , cuya habilidad especial era el camuflaje. Al verse en desventaja, se asusta, pero Kakashi lo motiva y se despierta el esperado Sharingan con el que lograron derrotar al primer enemigo.
Obito muriendo tras ser aplastado por una roca.
De vuelta junto a Rin , se enfrentan a un segundo enemigo que al final de la batalla utiliza una técnica doton para destruir la cueva donde estaban, Obito al ver en peligro a Kakashi se avienta sobre él y lo salva dando su vida justo cuando una de las partes de la cueva empezaba a caér, quedando la mitad de su cuerpo aplastada. Después de esto le dice a Kakashi que como no le dio regalo cuando el se convirtió en un Jounin , le obsequia su ojo con el Sharingan activado ya que estaba muriendo, Rin le implanta el ojo a Kakashi quien derrota con una gran ira al asesino de Obito; Kakashi esta apunto de enfrentarse a un gran número de enemigos cuando queda inconsciente, tiempo después se da cuenta de que su Sensei, Minato, los había salvado y ya sabía lo acontecido con Obito, el cual viviría en el sharingan de Kakashi por siempre.Esa es la razón por la que Kakashi a veces va a la roca de los héroes y se queda un buen rato mirándola.